על פי דוח הביקורת, בנוסף להישגים, בזמן הביקורת, ההנחיות ויישום תקנות הרישום של מחלקת החינוך וההכשרה של האי פונג עדיין היו כלולים כמה מגבלות, ליקויים והפרות.

על פי דו"ח הפיקוח של משרד החינוך וההכשרה, במהלך הבדיקה והאימות של תהליך הציונים לבחינת הכניסה לתיכון לכיתה י' במועצת הבחינות של מחלקת החינוך וההכשרה של האי פונג, נמצא כי חלק מהבוחנים לא הבינו במלואם את התקנות ועשו טעויות במהלך תהליך הציונים.

בטבלה 4 בדוח הציונים חסרה עמודה לרישום הציון הכולל/מספר קטגוריות הציון, דבר המקשה על השוואת הציונים ומגביר את הסיכון לטעויות במהלך תהליך הזנת הציון.

על פי תוכנית העבודה של ועדת הבחינה בנוגע לתהליך הקצאת קודים לדפי בחינה, שלב 2 בתהליך הקידוד אמור לשלב 10 דפי בחינה עבור מקצועות ייעודיים; אולם, בבדיקת שקיות הדפים עבור מקצועות ייעודיים, כל שקית הכילה 12 דפים.